как написать шел (по) одному или по-одному

Правильно - шёл ПО одному.

по-одному потому что суффикс ому
От числительного образуется наречие с приставкой по- и суффиксом -ому. Наречие зависит в предложении от глагола-сказуемого и пишется с дефисом, например: Охотники шли по-одному по болоту след в след.